Un poco de historia...

La idea de crear un jardín botánico en Xalapa nació a mediados de 1975, cuando por iniciativa del Instituto Nacional de Investigaciones sobre Recursos Bióticos, A.C. (INIREB), cuyo director, el Dr. Arturo Gómez-Pompa, recibió el apoyo del entonces Gobernador del Veracruz, Rafael Hernández Ochoa, para desarrollar el actual jardín en un terreno de casi siete hectáreas del Rancho Guadalupe, una propiedad de 76 hectáreas que el Gobierno de Veracruz había adquirido recientemente. 

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Durante las primeras etapas de actividad lo más importante fue que se establecieron las bases para el desarrollo de un sistema de registros, un método de mapeo y etiquetado, así como el diseño de un pequeño vivero. También se acordó mantener a largo plazo la asesoría de los reales Jardines Botánicos de Kew, en Londres, a través del horticultor Graham Pattison, quien junto con Andrew P. Vovides, fue fundador de la Asociación mexicana de Jardines Botánicos, A.C. Desde 1989, el Jardín Botánico Francisco Javier Clavijero forma parte del Instituto de Ecología, A.C.(INECOL).

Su nombre honra la memoria de un ilustre veracruzano nacido en el Puerto de Veracruz en 1731, Francisco Javier Clavijero, sacerdote jesuita que se distinguió por su sólida y extensa cultura, de la que sobresalen sus conocimientos de los recursos naturales y los pueblos de México. Clavijero es el autor, entre muchas otras obras, de la "Historia Antigua de México", obra importante sobre el pasado de nuestro país.